Su actividad sanitaria se desarrolla en el campo de la retina médica y quirúrgica, con especial énfasis en la degeneración macular y la retinopatía diabética.

Sus principales intereses de investigación clínica y básica son la degeneración macular, la retinopatía diabética, el desarrollo de nuevos fármacos para el tratamiento de la retina, la telemedicina y la inteligencia artificial para enfermedades de la retina.

En el campo de la investigación clínica, el dr. Zapata ha sido el investigador principal en 9 proyectos en los últimos 4 años y colaborador en más de 25 ensayos clínicos e investigación traslacional. En investigación básica, como principal en 3 proyectos y colaborador en 7 más.

Ha presentado comunicaciones a numerosos congresos nacionales e internacionales y actualmente tiene 43 publicaciones indexadas. Fundador y director médico de Upretina.